Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la salud pública.  
DOI: https://doi.org/10.56124/allpa.v8i16.0135  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la  
salud pública  
Intestinal microbiota and coccidiosis in poultry for consumption: risks to  
public health  
1
2
Mendoza-Mera Cristhian Eduardo ; Irina Lilibeth Villamar Guerrero ;  
3
Gamboa-Cevallos Henry Xavier  
1
Escuela Superior Politécnica Agropecuaria de Manabí Manual Félix López. Calceta, Ecuador.  
Correo: cristhian.mendoza.41@espam.edu.ec. ORCID ID: https://orcid.org/0009-0005-9925-4143  
2
Escuela Superior Politécnica Agropecuaria de Manabí Manual Félix López. Calceta, Ecuador.  
Correo: irina.villamar.41@espam.edu.ec. ORCID ID: https://orcid.org/0009-0002-9807-6793  
3
Escuela Superior Politécnica Agropecuaria de Manabí Manual Félix López. Calceta, Ecuador.  
Correo: hxgamboa@espam.edu.ec. ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-6148-8308  
Resumen  
La coccidiosis en aves de consumo constituye una de las principales enfermedades entéricas que afectan  
el desempeño productivo e incide sobre salud pública en general. La revisión tuvo el objetivo de explorar  
la interacción entre la microbiota intestinal y la coccidiosis en aves de consumo. Para su efecto, se  
desarrolló una revisión bibliográfica narrativa de carácter temático, la búsqueda de información se realizó  
en bases de datos científicas de alto impacto, priorizando literatura en español e inglés publicada entre  
2015 y 2025, y centrada en la producción avícola, la evidencia recopilada fue analizada de manera  
descriptiva y organizada en ejes temáticos en un marco conceptual analítico. Los resultados evidencian que  
la interacción entre la coccidiosis y la microbiota intestinal modula la respuesta inmunitaria del ave,  
favoreciendo la colonización por patógenos entéricos y comprometiendo la estabilidad funcional del tracto  
digestivo. Estas alteraciones tienen implicaciones directas sobre la inocuidad de los productos avícolas y  
constituyen un factor crítico de riesgo sanitario para los consumidores. En síntesis, la coccidiosis y la  
microbiota intestinal constituyen factores determinantes de la salud y seguridad alimentaria en la  
producción avícola.  
Palabras clave: Vigilancia sanitaria, enfermedades entéricas, seguridad alimentaria, aves de consumo, salud  
intestinal.  
Abstract  
Coccidiosis in poultry is one of the main enteric diseases affecting productive performance and has an  
impact on public health in general. The review aimed to explore the interaction between the intestinal  
microbiota and coccidiosis in poultry. To this end, a thematic narrative literature review was conducted,  
searching high-impact scientific databases, prioritizing literature in Spanish and English published between  
2015 and 2025, and focusing on poultry production. The evidence collected was analyzed descriptively and  
organized into thematic areas within an analytical conceptual framework. The results show that the  
interaction between coccidiosis and the intestinal microbiota modulates the bird's immune response,  
favoring colonization by enteric pathogens and compromising the functional stability of the digestive tract.  
These alterations have direct implications for the safety of poultry products and constitute a critical health  
risk factor for consumers. In summary, coccidiosis and the intestinal microbiota are determining factors in  
food health and safety in poultry production.  
Keywords: health surveillance, enteric diseases, food safety, poultry, intestinal health.  
3
23  
Fecha de recepción: 09 de abril de 2025; Fecha de aceptación: 18 de junio de 2025; Fecha de publicación:  
9 de julio del 2025.  
0
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Mendoza-Mera et al. (2025)  
1
. Introducción  
preventivos y terapéuticos (Lee et al.,  
022).  
2
La producción avícola intensiva ha  
crecido de forma sostenida en las  
últimas décadas debido a la elevada  
demanda de proteína animal, lo que ha  
impulsado avances en genética,  
nutrición, manejo y control sanitario  
Tradicionalmente, su control se ha  
basado en el uso de anticoccidiales y  
antibióticos. Sin embargo, el empleo  
prolongado de estos compuestos ha  
favorecido la aparición de resistencia  
(
Fatoba y Adeleke, 2018). No obstante,  
farmacológica  
y
ha disminuido su  
ha generado  
este progreso también ha generado  
nuevos desafíos en sanidad animal,  
entre ellos la coccidiosis, una  
enfermedad entérica causada por  
protozoarios del género Eimeria. Esta  
patología lesiona la mucosa intestinal de  
las aves, compromete su salud,  
disminuye su rendimiento productivo,  
incrementa los costos asociados al  
eficacia. También  
alteraciones en la microbiota intestinal,  
lo cual compromete la salud de las aves  
y aumentando su susceptibilidad a otras  
infecciones (Clavijo y Vives, 2018;  
Ahmad et al., 2024).  
Dado que la coccidiosis y el uso  
prolongado de antimicrobianos alteran  
la integridad intestinal, la microbiota ha  
adquirido un papel central en la  
investigación avícola contemporánea, al  
tratamiento  
y afecta la seguridad  
alimentaria del consumidor. Esto la  
convierte en uno de los principales  
problemas sanitarios de la avicultura a  
nivel mundial (Blake et al., 2020).  
reconocerse  
como  
un  
factor  
determinante en la salud, la inmunidad y  
el desarrollo de las aves destinadas al  
consumo humano (Kogut y Arsenault,  
La coccidiosis aviar es una enfermedad  
parasitaria de elevada relevancia global y  
constituye una de las principales causas  
de pérdidas económicas en la industria  
avícola. Se estiman pérdidas superiores a  
2016). La microbiota está compuesta por  
comunidades complejas de  
microorganismos que residen en el  
tracto gastrointestinal, desempeñando  
funciones esenciales como la digestión  
de nutrientes, la producción de  
metabolitos beneficiosos y la protección  
frente a microorganismos patógenos  
1
4,5 mil millones de dólares anuales  
debido a la disminución del crecimiento,  
la reducción de la eficiencia alimenticia y  
los costos derivados de tratamientos  
324  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la salud pública.  
(
Ahmad et al., 2024). Su equilibrio  
Diversas  
investigaciones  
han  
dinámico es fundamental para mantener  
la homeostasis intestinal y reducir la  
incidencia de enfermedades infecciosas  
demostrado que la suplementación con  
probióticos puede reducir de manera  
significativa las lesiones intestinales  
provocadas por la coccidiosis, mejorar  
los índices de conversión alimenticia y  
disminuir la carga parasitaria en aves  
infectadas (El-Shall et al., 2024;  
Javanmiri et al., 2024). De igual manera,  
la incorporación de aditivos prebióticos  
(
Aruwa et al., 2021).  
Diversos estudios han demostrado que  
la composición de la microbiota  
intestinal influye directamente en la  
susceptibilidad de las aves a infecciones  
parasitarias, incluida la coccidiosis (Yue  
et al., 2024). Una microbiota equilibrada  
puede ejercer efectos antiparasitarios  
mediante mecanismos como la exclusión  
como los fructo-oligosacáridos  
y
manano-oligosacáridos ha mostrado  
efectos favorables al estimular el  
crecimiento de bacterias benéficas y  
fortalecer la barrera intestinal (Bayat et  
al., 2024). Estas intervenciones se  
alinean con las directrices de organismos  
internacionales como la Organización de  
las Naciones Unidas para la Alimentación  
y la Agricultura (FAO, 2021) y la  
Organización Mundial de la Salud (OMS,  
competitiva,  
compuestos  
la  
producción  
de  
la  
antimicrobianos,  
modulación de la respuesta inmune y el  
fortalecimiento de la integridad de la  
barrera epitelial intestinal (Yang et al.,  
2023).  
En contraste, un desequilibrio en la  
microbiota intestinal, provocado por  
factores como el estrés, el uso excesivo  
2
019), que impulsan sistemas de  
producción avícola sostenibles y libres  
de antibióticos promotores de  
crecimiento.  
de  
antimicrobianos  
o
procesos  
infecciosos, deteriora la barrera epitelial,  
debilita la inmunidad y facilita la  
proliferación de Eimeria, aumentando  
así la susceptibilidad del huésped a  
El establecimiento temprano de la  
microbiota intestinal en las primeras  
semanas de vida de los aves es crítico, ya  
que coincide con una fase sensible en el  
desarrollo del sistema inmune del ave,  
por ende, una adecuada colonización  
infecciones y  
complicaciones entéricas (Lu et al.,  
021).  
parasitarias  
2
325  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Mendoza-Mera et al. (2025)  
microbiana permite una respuesta  
inmunológica más eficiente y menos  
inflamatoria frente a desafíos entéricos,  
lo que resulta relevante en la prevención  
de la coccidiosis (Clavijo y Vives, 2018;  
Yue et al., 2024). Por ello, el diseño de  
estrategias de manejo intestinal ha  
emergido como una herramienta  
fundamental en los programas de salud  
aviar.  
El objetivo fue explorar la interacción  
entre la microbiota intestinal y la  
coccidiosis en aves de consumo  
mediante una revisión narrativa,  
sintetizando el conocimiento actual,  
identificando riesgos asociados para la  
salud pública y revisando estrategias  
sostenibles de manejo que optimicen la  
producción avícola y el bienestar animal.  
2
. Metodología (materiales y métodos)  
La presente revisión narrativa es  
justificada por la necesidad de  
comprender la interacción entre la  
microbiota intestinal y la coccidiosis en  
aves de consumo. Debido a su impacto  
en la sanidad avícola, la seguridad  
alimentaria y la salud pública, la  
coccidiosis representa una preocupación  
importante para la industria avícola.  
Además, la resistencia farmacológica y  
los desequilibrios intestinales derivados  
del uso excesivo de antimicrobianos han  
generado desafíos significativos. Se  
plantea que el equilibrio de la microbiota  
intestinal actúa como factor protector  
frente a la coccidiosis aviar y sus  
repercusiones zoonóticas, por lo que su  
Se desplego una revisión bibliográfica  
narrativa de carácter conceptual, cuyo  
propósito fue explorar la interacción  
entre la microbiota intestinal y la  
coccidiosis en aves de consumo. El  
enfoque seleccionado responde a la  
naturaleza amplia y conceptual del tema  
abordado, así como a la diversidad de  
enfoques existentes en la literatura  
sobre  
Eimeria spp.,  
coccidiosis,  
microbiota intestinal y salud pública.  
La búsqueda bibliográfica se realizó en  
bases de datos científicas reconocidas,  
como PubMed, Scopus, Web of Science,  
ScienceDirect y Google Scholar. Para la  
búsqueda de información, se utilizaron  
palabras clave como: "microbiota  
intestinal en aves", "coccidiosis aviar",  
estudio  
y
mantenimiento cobran  
relevancia en la prevención y control de  
esta enfermedad.  
"
"
impacto en la salud pública",  
resistencia antimicrobiana en aves" y  
326  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la salud pública.  
"
patógenos zoonóticos", combinadas  
publicaciones fuera del periodo  
establecido y aquellos cuyo enfoque no  
con operadores booleanos (AND, OR,  
NOT) para optimizar los resultados.  
aportara  
elementos  
conceptuales  
relevantes para los objetivos de la  
revisión.  
Como criterios de inclusión, se consideró  
artículos publicados en los últimos 10  
años (2015-2025), en idioma inglés y  
español, estos deben abordar de forma  
directa aspectos relacionados con la  
microbiota intestinal de aves de  
consumo, la infección por Eimeria spp.,  
la fisiopatología de la coccidiosis, sus  
implicaciones productivas y los riesgos  
asociados para la salud pública,  
incluyendo la transmisión de patógenos  
La selección de antecedentes se  
desarrolló en función de los criterios de  
inclusión y exclusión, en la búsqueda de  
información se identificaron 140  
estudios relacionados con las palabras  
clave dispuestas anteriormente, de  
estos, 74 cumplieron con las  
delimitaciones de inclusión establecidos.  
Se excluyeron blogs, tesis, reportes no  
indexados, literatura sin revisión por  
zoonóticos  
y
la  
resistencia  
antimicrobiana.  
pares y documentos sin respaldo  
metodológico verificable. Pese a que no  
se aplicó una evaluación formal de la  
calidad de los estudios dado el enfoque  
de la revisión, se realizó una valoración  
crítica de la solidez teórica, la coherencia  
argumentativa y la pertinencia temática  
de cada fuente (Ver Tabla 1).  
Asimismo, se incorporaron informes  
técnicos de organismos internacionales  
(
FAO, OMS, OIE) y capítulos de libros  
especializados cuando ofrecieron  
contenido complementario de valor  
interpretativo. Se excluyeron  
documentos sin respaldo científico,  
estudios con información redundante,  
Tabla 1. Fases de selección de estudios  
Número de  
registros  
Fase  
Descripción del proceso  
Registros identificados en bases de datos científicas  
(
PubMed, Scopus, Web of Science, ScienceDirect,  
140  
Google Scholar).  
Identificación  
Cribado  
Registros identificados mediante otras fuentes (FAO,  
OMS, OIE y capítulos de libros).  
1
2
Total identificado  
Registros después de eliminar duplicados.  
152  
140  
327  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Mendoza-Mera et al. (2025)  
Registros excluidos por título y resumen (no relevantes,  
idioma diferente, información insuficiente).  
Registros restantes para lectura de texto completo.  
Artículos evaluados en texto completo.  
5
2
88  
88  
Elegibilidad  
Inclusión  
Artículos excluidos por no cumplir criterios de inclusión,  
por redundancia o por falta de rigor metodológico.  
Artículos científicos incluidos en la revisión final.  
Informes técnicos incluidos (FAO, OMS, OIE).  
Capítulos de libros incluidos.  
2
1
67  
4
3
Total final incluido en la síntesis narrativa  
74  
La información recabada se organizó en  
ejes temáticos como la Dinámica y  
funciones metabólicas de la microbiota  
intestinal en aves de engorde, la  
Interacción microbiota – Eimeria spp:  
3. Resultados y discusión  
Dinámica y funciones metabólicas de la  
microbiota intestinal en aves de engorde  
Desde el plano general de los principales  
filos bacterianos  
y
sus funciones  
mecanismos  
fisiopatológicos,  
productivas  
inmunológicos  
y
metabólicas, la microbiota intestinal de  
las aves está dominada por los filos  
las  
Implicaciones  
la interacción  
de  
Firmicutes,  
Bacteroidetes,  
microbiota–coccidiosis, el resistoma  
intestinal y riesgo zoonótico asociado a  
la coccidiosis y los riesgos para la salud  
pública y la seguridad alimentaria. Esta  
estructura permitió integrar los  
hallazgos recientes (2018 - 2025) y  
establecer conexiones entre la fisiología  
intestinal, la patogénesis de la  
coccidiosis y su impacto en la inocuidad  
alimentaria y la bioseguridad.  
Proteobacteria y Actinobacteria, con  
preponderancia de géneros como  
Lactobacillus, Clostridium y Bacteroides  
(
Wang et al., 2022; Zhang et al., 2022).  
Estas colonias, según Grond et al. (2018)  
y Zhang et al. (2022), ejercen funciones  
metabólicas esenciales, como la  
fermentación  
de  
carbohidratos  
complejos, la síntesis de ácidos grasos de  
cadena corta (AGCC) y la regulación de la  
homeostasis epitelial.  
Metabolitos  
como  
el  
butirato,  
propionato y acetato actúan como  
fuentes energéticas para los enterocitos,  
fortalecen la barrera intestinal  
y
328  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la salud pública.  
modulan la expresión génica de las  
proteínas de unión estrecha (Liu et al.,  
diversidad funcional o disbiosis afecta  
negativamente la respuesta  
2
021; Saint-Martin et al., 2024). En  
inmunológica, creando vulnerabilidades  
frente a patógenos ya que se altera el  
equilibrio entre bacterias beneficiosas y  
oportunistas (Fathima et al., 2022). Estas  
alteraciones no solo modifican la  
composición de la microbiota intestinal,  
sino que también interfiere en los  
mecanismos de comunicación entre el  
consecuencia, el equilibrio microbiano  
intestinal constituye un componente  
crítico de la fisiología digestiva y del  
estado  
inmunitario  
del  
ave,  
configurando un sistema funcional  
comparable a un órgano metabólico  
autónomo (El-Hack et al., 2022; Kogut &  
Miyakawa, 2022).  
epitelio  
y
el sistema inmune,  
comprometiendo la integridad del eje  
Existen variaciones en la microbiota  
según especie, edad, dieta, manejo y  
condiciones sanitarias (Jiang et al.,  
microbiota – epitelio – inmunidad local  
(
Tomal et al., 2023; Weng et al., 2024).  
2
020). que la estructura de la microbiota  
La interacción entre estos componentes  
constituye un sistema fisiológico esencial  
que asegura la homeostasis intestinal y  
intestinal varía significativamente con la  
edad, especie y condiciones de manejo  
(
Hasan & Yang, 2019; Rinninella et al.,  
019). En particular, en pollos de  
la resistencia frente  
a
agentes  
2
patógenos, la microbiota regula la  
expresión de citoquinas como IL-10, IFN-  
γ y TGF-β, modulando la inflamación y la  
tolerancia inmunológica, a su vez, la  
estimulación constante del epitelio por  
antígenos microbianos mantiene activa  
la inmunidad innata en las aves  
(Khasanah et al., 2024; (Yue et al., 2025).  
engorde  
jóvenes, predominan  
Escherichia-Shigella,  
Enterococcus  
y
mientras que en etapas posteriores se  
consolidan  
comunidades de  
Ruminococcus, que  
Lactobacillus  
y
promueven la estabilidad digestiva  
Zhou et al., 2021; Kim et al., 2025).  
(
Factores extrínsecos, como la dieta, la  
densidad poblacional, y la bioseguridad,  
influyen en la diversidad microbiana y en  
la colonización inicial del intestino  
Este sistema equilibrado limita la  
colonización de patógenos entéricos y  
optimiza  
la  
eficiencia  
digestiva  
(Ducatelle et al., 2023). Cuando la  
microbiota se altera por infección o uso  
(
McKenna et al., 2020). La pérdida de la  
329  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Mendoza-Mera et al. (2025)  
inadecuado de antimicrobianos se  
produce una ruptura en la homeostasis  
microbiana, exacerbando la patología  
(Teng et al., 2021).  
intestinal,  
que  
incrementa  
la  
Funcionalmente, la microbiota intestinal  
actúa como un modulador inmunológico  
clave, capaz de influir en la  
diferenciación de linfocitos T CD4+ y  
permeabilidad epitelial y compromete la  
inmunidad local (Kers et al., 2018).  
Interacción microbiota – Eimeria spp:  
mecanismos  
inmunológicos  
y
CD8+  
inmunoglobulina A secretora (sIgA)  
Wickramasuriya et al., 2022). Conforme  
y
en la secreción de  
fisiopatológicos  
(
La disbiosis por Eimeria spp. produce  
cambios sustanciales en la microbiota  
intestinal, generalmente se reducen las  
a Boyner et al. (2024) y De Alvarenga et  
al., (2025), la disbiosis causada por  
Eimeria altera este equilibrio, generando  
poblaciones  
de  
Lactobacillus  
y
respuestas  
inflamatorias  
Faecalibacterium,  
y
aumentan las  
Clostridium  
descontroladas.  
Enterobacteriaceae,  
perfringens Escherichia y Shigella (Huang  
et al., 2018; Karadedos et al., 2025). Esta  
condición se asocia con mayor severidad  
de lesiones en el ciego y yeyuno, lo que  
refleja la correlación entre el  
desequilibrio microbiano e inflamación  
Una disminución de Lactobacillus y de  
bacterias productoras de AGCC  
disminuye la síntesis de IL-10 y TGF-β,  
debilitando la respuesta reguladora y  
aumentando la inflamación mediada por  
IFN-γ (Attia et al., 2023). En  
(
Macdonald et al., 2017; Graham et al.,  
023).  
consecuencia,  
la  
composición  
2
microbiana determina la intensidad y la  
eficacia de la respuesta inmunitaria  
frente al parásito, siendo un factor  
modulador crítico del pronóstico de la  
infección (Choi & Kim, 2022; Liu et al.,  
Este proceso infecciosos, desequilibra el  
microambiente intestinal, elevando el  
pH y desarrollado condiciones propicias  
para las bacterias oportunistas (De  
Alvarenga et al., 2025). En síntesis, la  
infección coccidiana no solo causa daño  
directo por invasión tisular, sino también  
indirecto al modificar la ecología  
2023).  
Durante las fases avanzadas del proceso  
infeccioso, la disbiosis inducida por  
Eimeria provoca un daño estructural  
significativo en el intestino de las aves,  
330  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la salud pública.  
incluyendo la reducción de la longitud de  
las vellosidades, el aumento de la  
profundidad de las criptas y alteraciones  
en las proteínas de unión estrecha como  
ocludina, claudina y E-cadherina (Pham  
et al., 2021; Yuan et al., 2023; Zhou et al.,  
metabolismo energético, para Yin et al.  
(2015) y Kpodo et al. (2025), esta  
infección reduce la captación de  
aminoácidos y ácidos grasos, mientras  
que la alteración de la microbiota  
modifica  
la  
expresión  
de  
los  
2
023). Estas variaciones comprometen  
transportadores intestinales de glucosa  
(SGLT1), péptidos (PEPT1) y aminoácidos  
(EAAT3, CAT1), afectando directamente  
la eficiencia digestiva. Estos efectos se  
agravan por la inflamación sistémica y la  
pérdida de proteínas plasmáticas, lo que  
en conjunto deteriora la productividad  
avícola (Teng et al., 2021).  
la absorción de nutrientes y facilitan la  
translocación bacteriana, traduciéndose  
en procesos diarreicos, pérdida de peso  
y menor eficiencia alimenticia (Teng et  
al., 2023; Graham et al., 2023).  
Implicaciones productivas de la  
interacción microbiota–coccidiosis  
La gravedad de la coccidiosis varía según  
la especie de Eimeria involucrada, la  
dosis infectante y las condiciones de  
manejo. Eimeria tenella causa lesiones  
Los estudios de Guo et al. (2025) y  
Karadedos et al. (2025), sostienen que la  
coccidiosis reduce la ganancia diaria de  
peso y empeora el índice de conversión  
alimenticia debido al daño intestinal y la  
alteración de la microbiota, las aves  
infectadas presentan un descenso en la  
eficiencia alimentaria, incluso cuando la  
infección es subclínica. La pérdida de  
cecales hemorrágicas pérdida  
significativa de sangre (Zhou et al.,  
023). Mientras que E. acervulina y E.  
y
2
maxima afectan el duodeno y yeyuno,  
disminuyendo la absorción de nutrientes  
y el rendimiento de la canal (Santiani et  
al., 2023; Gazoni et al., 2025). Estas  
alteraciones fisiopatológicas derivan en  
menor ganancia de peso, incremento del  
consumo compensatorio y deterioro del  
índice de conversión alimenticia (De  
Freitas et al., 2023).  
función digestiva  
y
la menor  
disponibilidad de AGCC reducen la  
absorción de energía neta, afectando el  
crecimiento y el rendimiento productivo  
(
Zhang et al., 2022; Attia et al., 2023).  
A nivel fisiológico, la infección también  
altera la absorción de nutrientes  
esenciales  
y
compromete  
el  
331  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Mendoza-Mera et al. (2025)  
La  
evidencia  
científica  
reporta  
de resistencia, estos determinantes son  
transmisibles horizontalmente entre  
patógenos, lo que contribuye a un  
resistoma generalizado (Sun et al., 2019,  
Che et al., 2021).  
afectaciones en el contexto productivo  
asociadas a la coccidiosis en aves, la  
investigación de Freitas et al. (2023),  
mediante un metaanálisis de 55 estudios  
que  
comprendieron  
a
ensayos  
Lopes et al. (2024), Kador et al. (2025) y  
Cortés et al. (2025) destacan que, a nivel  
ambiental, los excrementos de las aves  
infectadas funcionan como un reservorio  
de bacterias resistentes y ooquistes  
viables con potencial infectante, estos  
materiales pueden alterar la microbiota  
del suelo y las fuentes de agua cercanas,  
favoreciendo la persistencia de  
patógenos y el intercambio de genes de  
resistencia entre microorganismos  
ambientales.  
experimentales con Eimeria spp. detectó  
una disminución significativa en la  
ganancia diaria de peso, así como una  
reducción en la eficiencia alimenticia. De  
forma  
complementaria,  
estudios  
recientes como los de Park et al. (2020);  
Teng et al. (2020): Lin y Olukosi (2021) y  
Qaid et al. (2022) han reportado  
consistentemente efectos negativos  
sobre el consumo de alimento, la  
ganancia de peso y la conversión  
alimenticia, reforzando la evidencia del  
impacto productivo de la coccidiosis bajo  
distintas condiciones experimentales.  
De forma complementaria, el uso  
prolongado  
de  
ionóforos  
y
antimicrobianos potencia la presión de  
selección sobre el resistoma aviar.  
Ionóforos como monensina y lasalocida,  
aunque considerados no antibióticos,  
pueden co-seleccionar resistencia en  
Resistoma intestinal y riesgo zoonótico  
asociado a la coccidiosis  
El uso constante e indiscriminado de  
antibióticos y anticoccidiales favorece la  
persistencia de genes de resistencia a  
antimicrobianos en la microbiota  
intestinal de las aves de consumo (Huang  
et al., 2018; Ribeiro et al., 2023). Las  
infecciones coccidianas alteran el  
equilibrio bacteriano y aumentan la  
cantidad de plásmidos que portan genes  
especies  
bacterianas  
oportunistas  
(Naemi et al., 2020; Doublet et al., 2024).  
El empleo continuo de estos compuestos  
modifica el resistoma intestinal,  
incrementando la abundancia de genes  
asociados  
a
eflujo  
y
degradación  
enzimática de antibióticos β-lactámicos  
332  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la salud pública.  
(
Doublet et al., 2024; Swinkels et al.,  
024).  
excreción se ve potenciada por la  
coinfección con Eimeria spp (Du et al.,  
2
2
024; Guo et al., 2025). Esta sinergia  
En general estos mecanismos reflejan  
como la interacción de la coccidiosis con  
el uso de fármacos y la contaminación  
ambiental contribuye a la diseminación  
persistente de genes de resistencia tanto  
en el hospedador como en el entorno  
patogénica incrementa la carga  
microbiana en el lumen intestinal y  
facilita la transmisión fecal-oral a través  
del alimento, el agua o el ambiente,  
especialmente en sistemas con  
deficiencias de bioseguridad (Macdonald  
et al., 2018; Aruwa et al., 2021).  
(
Samreen et al., 2021; Sassi et al., 2025).  
Este fenómeno no solo incide sobre la  
eficacia de los tratamientos  
En el proceso industrial de producción  
de pollos de engorde, se generan  
rupturas de intestinos contaminados,  
esto representa un punto crítico de  
contaminación cruzada, donde bacterias  
entéricas pueden transferirse a las  
canales y productos derivados (Papoula  
et al., 2025). La presencia de Eimeria se  
ha relacionado con una mayor carga  
microbiana superficial de la carne, lo que  
aumenta el riesgo de exposición humana  
a cepas zoonóticas multirresistentes  
antimicrobianos, sino que también  
representa un riesgo zoonótico  
emergente al facilitar la transmisión de  
determinantes de resistencia hacia  
bacterias de importancia clínica (Larsson  
&
Flach, 2021)  
Riesgos para la salud pública y la  
seguridad alimentaria  
La relación entre la coccidiosis y la  
disbiosis intestinal en aves de consumo,  
no solo compromete la homeostasis  
fisiológica y el desempeño de esta  
producción intensiva, sino que también  
se funge como un factor emergente de  
riego para la salud pública y la seguridad  
alimentaria (Miska et al., 2024). El  
desequilibrio microbiano intestinal de las  
aves favorece la proliferación de  
patógenos zoonóticos como Salmonella  
enterica y Campylobacter jejuni, cuya  
(
Miska et al., 2024; Du et al., 2024). En  
este contexto, la salud intestinal de las  
aves se convierte en un determinante  
transversal de la inocuidad alimentaria,  
con implicaciones directas en la  
trazabilidad, certificación sanitaria y  
acceso  
Venkitanarayanan et al., 2019; Aruwa et  
al., 2021).  
a
mercados  
regulados  
(
333  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Mendoza-Mera et al. (2025)  
En el ambiente, los ooquistes de Eimeria  
Spp y las bacterias resistentes persisten  
en las instalaciones por semanas,  
facilitar la diseminación de bacterias  
zoonóticas la propagación de  
y
elementos genéticos de resistencia  
antimicrobiana a lo largo de la cadena  
alimentaria.  
resistiendo condiciones adversas  
y
actuando como reservorios de genes de  
resistencia antimicrobiana (Kador et al.,  
Desde el enfoque de salud pública, el  
principal aporte de esta revisión radica  
en evidenciar que la interacción entre  
coccidiosis y microbiota intestinal puede  
2025; Cortés et al., 2025). Esta  
persistencia favorece la circulación  
horizontal de elementos genéticos  
móviles entre especies bacterianas, con  
amplificar los riesgos asociados  
a
potencial al  
microbioma humano o animal (Sun et al.,  
019, Che et al., 2021). Por tanto, el  
de  
transferencia  
patógenos zoonóticos, subrayando la  
necesidad de considerar la salud  
intestinal de las aves como un  
2
control integral de la coccidiosis no solo  
mejora el rendimiento productivo, sino  
que constituye una estrategia indirecta  
de itigación del resistoma ambiental  
componente  
estructural  
de  
la  
bioseguridad avícola.  
Bibliografía  
(
Doublet et al., 2024).  
Ahmad, R., Yu, Y., Hua, K., Chen, W.,  
Zaborski, D., Dybus, A., Hsiao F.,  
& Cheng, Y. (2024). Management  
and control of coccidiosis in  
poultry — A review. Animal  
4
. Conclusiones  
La síntesis narrativa evidenció que la  
microbiota intestinal en aves de  
consumo es un modulador crítico en la  
expresión y severidad de la coccidiosis  
por Eimeria spp., al influir en la  
inmunidad local, la estabilidad del tracto  
Bioscience. 1-15.  
https://doi.org/10.5713/ab.23.0  
89  
37(1)  
1
Aruwa, C., Pillay, C., Nyaga, M., & Sabiu,  
S. (2021). Poultry gut health –  
microbiome  
environmental  
functions,  
impacts,  
digestivo  
y
la susceptibilidad  
a
microbiome engineering and  
advancements in  
characterization technologies.  
Journal Of Animal Science And  
Biotechnology/Journal Of Animal  
Science And Biotechnology,  
patógenos entéricos. Estas alteraciones,  
además de incidir en el desempeño  
productivo de las aves, representan un  
punto crítico para la salud pública, al  
334  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la salud pública.  
1
2(1),  
https://doi.org/10.1186/s40104-  
21-00640-9  
119.  
https://doi.org/10.1111/j.1471-  
1842.2009.00848.x.  
0
Boyner, M., Ivarsson, E., Hansen, A.,  
Attia, M., Mohamed, R., & Salem, H.  
2023). Impact of Eimeria tenella  
experimental Infection on  
Lundén,  
A.,  
Ibrahim,  
O.,  
(
Söderlund, R., Cervin, G., Pavia,  
H., & Wattrang, E. (2024). Effects  
of a laminarin-rich algal extract  
on  
composition, leukocyte counts,  
parasite specific immune  
responses and growth rate  
during Eimeria tenella infection  
of broiler chickens. Veterinary  
intestinal and splenic reaction of  
broiler chickens. Journal Of  
Parasitic Diseases, 47(4), 829-  
caecal  
microbiota  
8
36.  
https://doi.org/10.1007/s12639-  
23-01629-z  
0
Bayat, M., Kuhi, H., Mehr, M. & Hossein-  
Zadeh, N. (2024). Dietary  
Parasitology, 110377.  
https://doi.org/10.1016/j.vetpar.  
024.110377  
334,  
prebiotic  
experimentally  
alleviates  
induced  
2
coccidiosis in broilers. Veterinary  
Science, 10.  
https://doi.org/https://d  
oi.org/10.3389/fvets.2023.1224  
47  
Che, Y., Yang, Y., Xu, X., Břinda, K., Polz,  
M. F., Hanage, W. P., & Zhang, T.  
(2021). Conjugative plasmids  
interact with insertion sequences  
to shape the horizontal transfer  
of antimicrobial resistance genes.  
Proceedings Of The National  
Academy Of Sciences, 118(6).  
https://doi.org/10.1073/pnas.20  
6
Blake, D., Knox, J., Dehaeck, B.,  
Huntington, B., Rathinam, T.,  
Ravipati, V., Ayoade, S., Gilbert,  
W., Adebambo, A., Jatau, I.,  
Raman, M., Parker, D., Rushton,  
J., & Tomley, F. (2020). Re-  
0
8731118  
Choi, J., & Kim, W. (2022). Interactions of  
Microbiota and Mucosal  
calculating of  
the  
cost  
coccidiosis in chickens.  
Immunity in the Ceca of Broiler  
Chickens Infected with Eimeria  
tenella. Vaccines, 10(11), 1941.  
https://doi.org/10.3390/vaccine  
s10111941  
Veterinary  
Research,  
115.  
5
1(1),  
https://doi.org/10.1186/s13567-  
20-00837-2  
0
Booth, A. (2009). A typology of reviews:  
An analysis of 14 review types  
and associated methodologies.  
Health Information & Libraries  
Clavijo, V., y Vives, M. (2018). The  
gastrointestinal microbiome and  
its association with the control of  
pathogens in broiler chicken  
production: A review. Poultry  
Journal,  
26(2),  
91–108.  
Science,  
97(3),  
1006-1021.  
335  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Mendoza-Mera et al. (2025)  
https://doi.org/https://doi.org/1  
.3382/ps/pex359  
symposium on Antimicrobial  
Resistance in Animals and the  
Environment (ARAE 2023).  
Frontiers In Microbiology, 15,  
509192.  
https://doi.org/10.3389/fmicb.2  
24.1509192  
0
Cortés, P., Pokrant, E., Yévenes, K.,  
Maddaleno, A., Flores, A., Vargas,  
M. B., Trincado, L., Maturana, M.,  
Lapierre, L., & Cornejo, J. (2025).  
Antimicrobial Residues in Poultry  
Litter: Assessing the Association  
of Antimicrobial Persistence with  
Resistant Escherichia coli Strains.  
1
0
Du, S., Song, Z., Cen, Y., Fan, J., Li, P., Si,  
H., & Hu, D. (2024). Susceptibility  
and cecal microbiota alteration  
to Eimeria-infection in Yellow-  
feathered broilers, Arbor Acres  
broilers and Lohmann pink  
layers. Poultry Science, 103(7),  
Antibiotics,  
14(1),  
89.  
https://doi.org/10.3390/antibioti  
cs14010089  
De Alvarenga, P., Paulino, P., Da Silva, N.,  
Galdino, K., Rabello, C., De Souza,  
F. G., Reis, T., Machado, L., De  
Resende, F., & Santos, H. (2025).  
Dose and age-dependent effects  
of Eimeria spp. infection on  
cytokine and intestinal integrity  
gene expression in broiler  
1
03824.  
https://doi.org/10.1016/j.psj.20  
4.103824  
2
Ducatelle, R., Goossens, E., Eeckhaut, V.,  
& Van Immerseel, F. (2023).  
Poultry gut health and beyond.  
Animal Nutrition, 13, 240-248.  
https://doi.org/10.1016/j.aninu.  
2023.03.005  
chickens.  
Parasitology,  
Veterinary  
338, 110550.  
https://doi.org/10.1016/j.vetpar.  
025.110550  
El-Hack, M. E. A., El-Saadony, M. T.,  
Alqhtani, A. H., Swelum, A. A.,  
Salem, H. M., Elbestawy, A. R.,  
Noreldin, A. E., Babalghith, A. O.,  
Khafaga, A. F., Hassan, M. I., & El-  
Tarabily, K. A. (2022). The  
2
De Freitas, L., Sakomura, N., De Paula,  
M., Mariani, A., Lambert, W.,  
Andretta, I., & Létourneau, M.  
(
2023). Coccidiosis infection and  
growth performance of broilers  
in experimental trials: insights  
from a meta-analysis including  
modulating factors. Poultry  
relationship  
influenza, gut microbiota and  
chicken immunity: an updated  
overview.  
101(9),  
https://doi.org/10.1016/j.psj.20  
22.102021  
among  
avian  
Poultry  
Science,  
102021.  
Science, 103021.  
https://doi.org/10.1016/j.psj.20  
3.103021  
102(11),  
2
Doublet, B., Leclercq, S., Zygmunt, M., &  
Cloeckaert, A. (2024). Editorial:  
Conference Research Topic: 9th  
El-Shall, N., El-Naggar, K., El-Kasrawy, N.,  
Elblehi, S., Albadrani, G., Al-  
Ghadi, M., & Abdel-Daim, M.  
336  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la salud pública.  
(
2024) The anticoccidial effects  
Poultry  
Science,  
27(1).  
of probiotics and prebiotics on  
the live coccidia vaccine and the  
subsequent influence on poultry  
performance post-challenge with  
mixed Eimeria species Poultry  
https://doi.org/10.1590/1806-  
9061-2024-1994  
Graham, D., Petrone, V. M., Hernandez,  
X., Coles, M., Juarez, M. A.,  
Latorre, J. D., Chai, J., Shouse, S.,  
Zhao, J., Forga, A., Senas, R.,  
Laverty, L., Martin, K., Trujillo, C.,  
Loeza, I., Gray, L. S., Hargis, B., &  
Tellez, G. (2023). Assessing the  
effects of a mixed Eimeria spp.  
challenge on performance,  
intestinal integrity, and the gut  
microbiome of broiler chickens.  
Frontiers In Veterinary Science,  
Science  
https://doi.org/10.1016/j.psj.20  
4.104283  
103(12)  
2
FAO. (2021). Panorama de la producción  
avícola en América Latina.  
Organización de las Naciones  
Unidas para la Alimentación y la  
Agricultura.  
Fathima, S., Shanmugasundaram, R.,  
Adams, D., & Selvaraj, R. K.  
1
0, 1224647.  
https://doi.org/10.3389/fvets.20  
3.1224647  
(
2022).  
Gastrointestinal  
and Their  
2
Microbiota  
Manipulation for Improved  
Growth and Performance in  
Chickens. Foods, 11(10), 1401.  
https://doi.org/10.3390/foods11  
Grond, K., Sandercock, B., Jumpponen,  
A., & Zeglin, L. (2018). The avian  
gut microbiota: community,  
physiology and function in wild  
birds. Journal Of Avian Biology,  
101401  
4
9(11).  
Fatoba, A., y Adeleke, M. (2018).  
Diagnosis and control of chicken  
coccidiosis: A recent update.  
Journal of Parasitic Diseases,  
https://doi.org/10.1111/jav.017  
88  
Guo, J., Zhao, Z., Broadwater, C., Tobin,  
I., Liu, J., Whitmore, M., & Zhang,  
G. (2025). Is Intestinal Microbiota  
Fully Restored After Chickens  
4
2(4), 483–493.  
https://doi.org/https://doi.org/1  
.1007/s12639-018-1048-1  
0
Have from  
Coccidiosis? Pathogens, 14(1),  
1.  
https://doi.org/10.3390/pathoge  
ns14010081  
Recovered  
Gazoni, F., Stefanello, C., Santos, H.,  
Boiago, M., Galli, G., Tellez, G., &  
Juarez, M. (2025). Monitoring  
Avian Coccidiosis Incidence in  
8
Broiler  
Farms  
in  
Brazil:  
Integrating Eimeria sp. Lesion  
Scoring with Direct Micro-  
Quantification of E. maxima  
Oocysts. Brazilian Journal Of  
Hasan, N., & Yang, H. (2019). Factors  
affecting the composition of the  
gut its  
microbiota,  
and  
modulation. PeerJ, 7, e7502.  
337  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Mendoza-Mera et al. (2025)  
https://doi.org/10.7717/peerj.75  
Abundance and transmission of  
antibiotic resistance and  
02  
virulence genes through mobile  
genetic elements in integrated  
chicken and fish farming system.  
Scientific Reports, 15(1), 20953.  
https://doi.org/10.1038/s41598-  
Huang, G., Tang, X., Bi, F., Hao, Z., Han,  
Z., Suo, J., Zhang, S., Wang, S.,  
Duan, C., Yu, Z., Yu, F., Yu, Y., Lv,  
Y., Suo, X., & Liu, X. (2018).  
Eimeria  
tenella  
infection  
025-92921-w  
perturbs the chicken gut  
microbiota from the onset of  
oocyst shedding. Veterinary  
Karadedos, D., Mantzios, T., Kiousi, D.,  
Tsifintaris, M., Giannenas, I.,  
Sakkas, P., Papadopoulos, G.,  
Antonissen, G., Pappa, A.,  
Galanis, A., & Tsiouris, V. (2025).  
Metagenomic Insight into Cecal  
Microbiota Shifts in Broiler Chicks  
Parasitology, 30-37.  
https://doi.org/10.1016/j.vetpar.  
018.06.005  
258,  
2
Javanmiri, E., Rahimi, S., Karimi, M.,  
Nabiyan, S., Behnamifar, A., &  
Grimes, J. (2024). Comparison of  
the effect of anticoccidial drug,  
Following  
Eimeria  
spp.  
Vaccination.  
Microorganisms,  
1470.  
13(7),  
probiotic,  
synbiotic,  
https://doi.org/10.3390/microor  
ganisms13071470  
phytochemicals and vaccine in  
prevention and control of  
coccidiosis in broiler chickens  
challenged with Eimeria spp.  
Kers, J., Velkers, F., Fischer, E., Hermes,  
G., Stegeman, J., & Smidt, H.  
(2018). Host and Environmental  
Factors Affecting the Intestinal  
Microbiota in Chickens. Frontiers  
Poultry 103(12)  
https://doi.org/10.1016/j.psj.20  
4.104357  
Science  
2
In Microbiology, 235.  
https://doi.org/10.3389/fmicb.2  
18.00235  
9,  
Jiang, H., Chen, W., Su, L., Huang, M., Lin,  
L., Su, Q., Li, G., Ahmad, H. I., Li,  
L., Zhang, X., Li, H., & Chen, J.  
0
(
2020).  
Impact  
of  
host  
Khasanah, H.,  
Kusbianto,  
D.,  
intraspecies genetic variation,  
diet, and age on bacterial and  
fungal intestinal microbiota in  
tigers. MicrobiologyOpen, 9(7),  
e1050.  
Purnamasari, L., Cruz, J.,  
Widianingrum, D., & Hwang, S.  
(2024). Modulation of chicken  
gut microbiota for enhanced  
productivity and health:  
A
https://doi.org/10.1002/mbo3.1  
review. Veterinary World, 17(5),  
1073-1083.  
050  
https://doi.org/10.14202/vetwor  
ld.2024.1073-1083  
Kador, S., Islam, K., Rubaiyat, R., Bhuiyan,  
M., Chakrovarty, T., Rahman, S.,  
Islam, O., & Islam, M. (2025).  
338  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la salud pública.  
Kim, H. W., Kim, N. K., Wolf, P. G.,  
Brandvold, K., Rehberger, J. M.,  
Rehberger, T. G., Dilger, R. N.,  
Smith, A. H., & Mackie, R. I.  
chickens challenged with Eimeria  
maxima. Frontiers In Veterinary  
Science, 11, 1501286.  
https://doi.org/10.3389/fvets.20  
24.1501286  
(
2025). Intestinal microbiota  
composition and bile salt  
hydrolase activity in fast and slow  
Larsson, D., & Flach, C. (2021). Antibiotic  
resistance in the environment.  
Nature Reviews Microbiology,  
growing  
implications  
broiler  
for  
chickens:  
growth  
2
0(5), 257-269.  
https://doi.org/10.1038/s41579-  
21-00649-x  
performance and production  
efficiency. Journal Of Animal  
0
Science  
And  
Biotechnology/Journal Of Animal  
Science And Biotechnology,  
Lee, Y., Luand, M., & Lillehoj, H. (2022).  
Coccidiosis: Recent Progress in  
Host Immunity and Alternatives  
to Antibiotic Strategies. Vaccines,  
10(215).  
1
6(1), 108.  
https://doi.org/10.1186/s40104-  
25-01243-4  
0
https://doi.org/10.3390/vaccine  
s10020215  
Kogut, M., & Fernandez, M. (2022).  
Editorial: Functional mechanisms  
at the avian gut microbiome-  
intestinal immunity interface and  
Lin, Y., Xie, Y., Hao, Z., Bi, H., Liu, Y., Yang,  
X., & Xia, Y. (2021). Protective  
Effect of Uric Acid on ox-LDL-  
Induced HUVECs Injury via  
its  
physiological  
Frontiers In Physiology, 13,  
063102.  
https://doi.org/10.3389/fphys.2  
22.1063102  
regulation  
of  
avian  
responses.  
Keap1-Nrf2-ARE  
Pathway.  
1
Journal  
Of  
Immunology  
Research,  
2021,  
1-19.  
0
https://doi.org/10.1155/2021/5  
51168  
1
Kogut, M., y Arsenault, R. (2016). The  
New Paradigm in Food Animal  
Liu, G., Ajao, A. M., Shanmugasundaram,  
R., Taylor, J., Ball, E., Applegate,  
T. J., Selvaraj, R., Kyriazakis, I.,  
Olukosi, O., & Kim, W. (2023).  
The effects of arginine and  
branched-chain amino acid  
supplementation to reduced-  
protein diet on intestinal health,  
cecal short-chain fatty acid  
profiles, and immune response in  
broiler chickens challenged with  
Eimeria spp. Poultry Science,  
Production.  
Veterinary  
https://doi:  
Frontiers  
Science,  
in  
3(71).  
10.3389/fvets.2016.00071  
Kpodo, K. R., Miska, K. B., Schreier, L. L.,  
Milliken, D. J., & Proszkowiec-  
Weglarz, M. (2025). Effects of  
butyric acid glycerol ester  
supplementation on intestinal  
nutrient and  
transporter  
immune-related genes in broiler  
339  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Mendoza-Mera et al. (2025)  
1
02(7),  
https://doi.org/10.1016/j.psj.20  
3.102773  
102773.  
https://doi.org/10.1128/iai.0077  
2-18  
2
Macdonald, S., Nolan, M., Harman, K.,  
Boulton, K., Hume, D., Tomley, F.,  
Stabler, R., & Blake, D. (2017).  
Effects of Eimeria tenella  
infection on chicken caecal  
microbiome diversity, exploring  
variation associated with severity  
of pathology. PLoS ONE, 12(9),  
e0184890.  
Liu, L., Li, Q., Yang, Y., & Guo, A. (2021).  
Biological Function of Short-  
Chain Fatty Acids and Its  
Regulation on Intestinal Health of  
Poultry. Frontiers In Veterinary  
Science, 736739.  
https://doi.org/10.3389/fvets.20  
1.736739  
8,  
2
https://doi.org/10.1371/journal.  
pone.0184890  
Lopes, E., Santaren, K., De Souza, L.,  
Parente, C., Picão, R., De Azevedo  
Jurelevicius, D., & Seldin, L.  
McKenna, A., Ijaz, U. Z., Kelly, C., Linton,  
M., Sloan, W. T., Green, B. D.,  
Lavery, U., Dorrell, N., Wren, B.  
(
2024).  
Cross-environmental  
of antimicrobial  
cycling  
resistance in agricultural areas  
fertilized with poultry litter: A  
W.,  
Richmond,  
A.,  
Corcionivoschi, N., & Gundogdu,  
O. (2020). Impact of industrial  
production system parameters  
one  
Environmental Pollution, 363(Pt  
), 125177.  
https://doi.org/10.1016/j.envpol  
2024.125177  
health  
approach.  
1
on  
chicken  
microbiomes:  
mechanisms  
performance  
Campylobacter.  
to  
and  
improve  
reduce  
.
Microbiome,  
128.  
Lu, C., Yan, Y., Jian, F. & Ning, C. (2021).  
Coccidia-Microbiota Interactions  
and Their Effects on the Host.  
Frontiers in Cellular and Infection  
8(1),  
https://doi.org/10.1186/s40168-  
20-00908-8  
0
Microbiology,  
https://doi:10.3389/fcimb.2021.  
51481  
11,  
Miska, K., Campos, P., Cloft, S., Jenkins,  
M., & Proszkowiec, M. (2024).  
Temporal Changes in Jejunal and  
Ileal Microbiota of Broiler  
Chickens with Clinical Coccidiosis  
7
Macdonald, E., Van Diemen, P.,  
Martineau, H., Stevens, M.,  
Tomley, F., Stabler, R., & Blake, D.  
(
1
Eimeria maxima). Animals,  
4(20), 2976.  
https://doi.org/10.3390/ani1420  
976  
(
2018). Impact of Eimeria tenella  
Coinfection on Campylobacter  
jejuni Colonization of the  
Chicken. Infection And Immunity,  
2
Moore, R., Park, S., Kubena, L., Byrd, J.,  
McReynolds, J., Burnham, Hume,  
M., Birkhold, S., Nisbet, D., &  
87(2).  
340  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la salud pública.  
Ricke, S. (2004). Comparison of  
zinc acetate and propionate  
addition on gastrointestinal tract  
fermentation and susceptibility  
of laying hens to Salmonella  
enteritidis during forced molt.  
Poultry Science, 83(8), 1276-  
of dietary Bacillus subtilis  
supplementation, as an  
alternative to antibiotics, on  
growth performance, intestinal  
immunity, and epithelial barrier  
integrity in broiler chickens  
infected with Eimeria maxima.  
Poultry Science, 99(2), 725-733.  
https://doi.org/10.1016/j.psj.20  
19.12.002  
1
286.  
https://doi.org/10.1093/ps/83.8.  
276  
1
Naemi, A., Dey, H., Kiran, N., Sandvik, S.  
T., Slettemeås, J. S., Nesse, L. L.,  
Pham, H., Matsubayashi, M., Tsuji, N., &  
Hatabu, T. (2021). Relationship  
&
Simm, R. (2020). NarAB Is an  
between  
Eimeria  
tenella  
ABC-Type Transporter That  
Confers Resistance to the  
Polyether Ionophores Narasin,  
Salinomycin, and Maduramicin,  
but Not Monensin. Frontiers In  
associated-early clinical signs and  
molecular changes in the  
intestinal  
barrier  
function.  
Veterinary Immunology And  
Immunopathology, 240, 110321.  
https://doi.org/10.1016/j.vetim  
m.2021.110321  
Microbiology, 104.  
https://doi.org/10.3389/fmicb.2  
20.00104  
11,  
0
Qaid, M., Al-Mufarrej, S., Azzam, M., Al-  
Garadi, A., Alqhtani, H., Al-  
Abdullatif, A., Hussein, E., &  
Suliman, G. (2022). Dietary  
Cinnamon Bark Affects Growth  
OMS. (2019). Uso prudente de  
antimicrobianos en animales  
destinados a la producción de  
alimentos. Ginebra: Organización  
Mundial de la Salud.  
Performance,  
Carcass  
Characteristics, and Breast Meat  
Quality in Broiler Infected with  
Eimeria tenella Oocysts. Animals,  
Papoula, R., Abdulla, K., Silver, G., Kellett,  
A., & Antic, D. (2025). An  
evaluation of the impact of  
abattoir processing on the levels  
of Campylobacter spp. and  
Enterobacteriaceae on broiler  
1
2(2), 166.  
https://doi.org/10.3390/ani1202  
166  
0
carcasses.  
Microbiology, 16, 1613058.  
https://doi.org/10.3389/fmicb.2  
Frontiers  
In  
Ribeiro, J., Silva, V., Monteiro, A., Vieira,  
M., Igrejas, G., Reis, F., Barros, L.,  
& Poeta, P. (2023). Antibiotic  
025.1613058  
Resistance  
among  
Gastrointestinal Bacteria in  
Broilers: A Review Focused on  
Park, I., Lee, Y., Goo, D., Zimmerman, N.,  
Smith, A., Rehberger, T., &  
Lillehoj, H. S. (2019). The effects  
Enterococcus and  
spp.  
Escherichia coli. Animals, 13(8),  
341  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Mendoza-Mera et al. (2025)  
1
362.  
https://doi.org/10.3390/ani1308  
362  
T., & Casagrande, R. A. (2023b).  
Characterization of coccidiosis  
and evaluation of suggestive  
cases of subclinical necrotic  
enteritis in broilers. Pesquisa  
1
Rinninella, E., Raoul, P., Cintoni, M.,  
Franceschi, F., Miggiano, G. A. D.,  
Gasbarrini, A., & Mele, M. C.  
Veterinária 43.  
https://doi.org/10.1590/1678-  
150-pvb-7090  
Brasileira,  
(
2019). What is the Healthy Gut  
5
Microbiota Composition?  
A
Changing Ecosystem across Age,  
Environment, Diet, and Diseases.  
Sassi, A., Basher, N., Kirat, H., Meradji, S.,  
Ibrahim, N. A., Idres, T., & Touati,  
A. (2025). The Role of the  
Environment (Water, Air, Soil) in  
Microorganisms,  
7(1),  
14.  
https://doi.org/10.3390/microor  
ganisms7010014  
the and  
Dissemination of Antimicrobial  
Resistance: One Health  
Perspective. Antibiotics, 14(8),  
64.  
Emergence  
Saint, V., Guillory, V., Chollot, M.,  
Fleurot, I., Kut, E., Roesch, F.,  
A
Caballero,  
I., Helloin,  
E.,  
7
Chambellon, E., Ferguson, B.,  
Velge, P., Kempf, F., Trapp, S., &  
Guabiraba, R. (2024). The gut  
microbiota and its metabolite  
butyrate shape metabolism and  
antiviral immunity along the gut-  
lung axis in the chicken.  
Communications Biology, 7(1),  
https://doi.org/10.3390/antibioti  
cs14080764  
Shira, E. B., & Friedman, A. (2018). Innate  
immune functions of avian  
intestinal  
epithelial  
cells:  
Response to bacterial stimuli and  
localization of responding cells in  
the developing avian digestive  
1
185.  
https://doi.org/10.1038/s42003-  
24-06815-0  
tract.  
PLoS  
ONE,  
13(7),  
0
e0200393.  
https://doi.org/10.1371/journal.  
pone.0200393  
Samreen, N., Ahmad, I., Malak, H., &  
Abulreesh,  
H.  
(2021).  
Environmental  
antimicrobial  
Sun, D., Jeannot, K., Xiao, Y., & Knapp, C.  
W. (2019). Editorial: Horizontal  
resistance and its drivers: a  
potential threat to public health.  
Journal Of Global Antimicrobial  
Gene  
Transfer  
Mediated  
Bacterial Antibiotic Resistance.  
Frontiers In Microbiology, 10,  
1933.  
Resistance, 101-111.  
https://doi.org/10.1016/j.jgar.20  
1.08.001  
27,  
2
https://doi.org/10.3389/fmicb.2  
0
19.01933  
Santiani, F., Silva, R. o. S., De Oliveira  
Júnior, C. A., Withoeft, J. A.,  
Cristo, T. G., Costa, L. S., Gaspar,  
Swinkels, A., Berendsen, J., Fischer, E.,  
Zomer, L., & Wagenaar, J. (2024).  
342  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la salud pública.  
Extended period of selection for  
antimicrobial resistance due to  
persistency of antimicrobials in  
broilers. bioRxiv (Cold Spring  
Tomal, F., Sadrin, G., Gaboriaud, P.,  
Guitton, E., Sedano, L., Lallier, N.,  
Rossignol, C., Larcher, T., Rouille,  
E., Ledevin, M., Guabiraba, R.,  
Silvestre, A., Lacroix-Lamandé, S.,  
Schouler, C., Laurent, F., &  
Bussière, F. I. (2023). The caecal  
microbiota promotes the acute  
inflammatory response and the  
loss of the intestinal barrier  
integrity during severe Eimeria  
tenella infection. Frontiers In  
Harbor  
https://doi.org/10.1101/2024.04  
18.590069  
Laboratory).  
.
Teng, P., Choi, J., Tompkins, Y., Lillehoj,  
H., & Kim, W. (2021). Impacts of  
increasing challenge with Eimeria  
maxima  
on  
the  
and  
growth  
gene  
performance  
expression  
associated  
integrity  
Cellular  
And  
Infection  
of  
biomarkers  
intestinal  
nutrient  
Microbiology, 13, 1250080.  
https://doi.org/10.3389/fcimb.2  
with  
and  
023.1250080  
transporters.  
Research,  
Veterinary  
52(1),  
81.  
Venkitanarayanan, K., Thakur, S., &  
Ricke, S. C. (2019). Food Safety in  
https://doi.org/10.1186/s13567-  
21-00949-3  
0
Poultry  
Meat  
Production.  
Springer.  
Teng, P., Liu, G., Choi, J., Yadav, S., Wei,  
F., & Kim, W. (2023). Effects of  
Wang, J., Hong, M., Long, J., Yin, Y., & Xie,  
J. (2022). Differences in intestinal  
microflora of birds among  
levels  
of  
methionine  
supplementations in forms of L-  
or DL-methionine on the  
different  
Frontiers In Ecology And  
Evolution, 10.  
https://doi.org/10.3389/fevo.20  
22.920869  
ecological  
types.  
performance,  
intestinal  
development, immune response,  
and antioxidant system in  
broilers challenged with Eimeria  
spp. Poultry Science, 102(5),  
Weng, S., Tian, E., Gao, M., Zhang, S.,  
Yang, G., & Zhou, B. (2024b).  
Eimeria: Navigating complex  
intestinal ecosystems. PLoS  
Pathogens, 20(11), e1012689.  
https://doi.org/10.1371/journal.  
ppat.1012689  
1
02586.  
https://doi.org/10.1016/j.psj.20  
3.102586  
2
Teng, T., Wang, Y., Zhu, X., Zhang, X., Yi,  
S., Fan, G., & Liu, B. (2021).  
Numerical Analysis on the  
Storage of Nuclear Waste in Gas-  
Saturated Deep Coal Seam.  
Wickramasuriya, S., Park, I., Lee, K., Lee,  
Y., Kim, W. H., Nam, H., & Lillehoj,  
H. S. (2022). Role of Physiology,  
Geofluids, 1-12.  
https://doi.org/10.1155/2021/3  
77131  
2021,  
Immunity,  
Microbiota,  
and  
2
343  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Mendoza-Mera et al. (2025)  
Infectious Diseases in the Gut  
Health of Poultry. Vaccines,  
Synbiotics, and Postbiotics in  
Livestock and Poultry Gut Health:  
A Review. Metabolites, 15(7),  
478.  
10(2),  
172.  
https://doi.org/10.3390/vaccine  
s10020172  
https://doi.org/10.3390/metabo  
1
5070478  
Yang, C., Das, Q., Rehman, M., Yin, X.,  
Shay, J., Gauthier, M., Lau, C.,  
Ross, K. & Diarra, M. (2023).  
Microbiome of ceca from broiler  
chicken vaccinated or not against  
coccidiosis and fed berry  
pomaces. Microorganisms, 11(5),  
Yue, Y., Luasiri, P., Li, J., Laosam, P. &  
Sangsawad, P. (2024). Research  
advancements on the diversity  
and host interaction of gut  
microbiota in chickens. Frontiers  
in  
Veterinary  
Science,  
1184.  
11:1492545.  
https://doi.org/https://doi.org/1  
https://doi:10.3389/fvets.2024.1  
492545  
0.3390/microorganisms1105118  
4
Zhang, K., Wang, X., Gong, X., & Sui, J.  
Yin, H., Sumners, L., Dalloul, R., Miska, K.,  
Fetterer, R., Jenkins, M., Zhu, Q.,  
(2022).  
Gut  
Microbiome  
Differences in Rescued Common  
Kestrels (Falco tinnunculus)  
Before and After Captivity.  
Frontiers In Microbiology, 13,  
858592.  
&
Wong, E. (2015). Changes in  
expression of an antimicrobial  
peptide, digestive enzymes, and  
nutrient transporters in the  
intestine of E. praecox-infected  
chickens. Poultry Science, 94(7),  
https://doi.org/10.3389/fmicb.2  
022.858592  
1
521-1526.  
Zhou, Q., Lan, F., Li, X., Yan, W., Sun, C.,  
Li, J., Yang, N., & Wen, C. (2021).  
The Spatial and Temporal  
https://doi.org/10.3382/ps/pev1  
33  
Yuan, Y., Yang, L., Zhao, Q., Suo, X., &  
Hao, Z. (2023). Matrine provides  
Characterization  
of  
Gut  
Microbiota in Broilers. Frontiers  
In Veterinary Science, 8, 712226.  
https://doi.org/10.3389/fvets.20  
21.712226  
a
protective effect against  
Eimeria tenella challenge by  
alleviating intestinal barrier  
damage. Veterinary Parasitology,  
Zhou, X., Wang, L., Wang, Z., Zhu, P.,  
Chen, Y., Yu, C., Chen, S., & Xie, Y.  
3
19, 109940.  
https://doi.org/10.1016/j.vetpar.  
023.109940  
(
2023). Impacts of Eimeria  
2
coinfection on growth  
Yue, T., Lu, Y., Ding, W., Xu, B., Zhang, C.,  
Li, L., Jian, F., & Huang, S. (2025).  
The Role of Probiotics, Prebiotics,  
performance, intestinal health  
and immune responses of broiler  
chickens.  
Veterinary  
344  
Revista de Ciencias Agropecuarias ‘‘ALLPA’’: Vol. 8 (Núm. 16) (jul-dic 2025). ISSN: 2600-5883.  
Microbiota intestinal y coccidiosis en aves de consumo: riesgos para la salud pública.  
Parasitology, 110019.  
https://doi.org/10.1016/j.vetpar.  
023.110019  
322,  
2
345